輸出通関の流れは、貨物が保税地域に搬入されて、輸出申告が行なわれ、税関における審査と検査が実施された後に輸出許可を得る。
輸入通関の流れは、貨物を本船から荷卸して、保税地域に搬入してから輸入申告を行なう。その後、税関で輸入検査と審査が行なわれ、貨物に順ずる関税を納付して輸入許可を受領する。
英語表記:【custom clearance】